系统分析是一种科学方法，其特点在于以跨学科的途径解决复杂问题。系统分析的对象，是与创建新系统、改造现有系统相关的实际问题——组织的、经济的、技术的、信息的、军事的等等。
系统分析用于查明现存困难的成因、确立目标，并制定消除问题的方法与方案。它起着组织者和协调者的作用：依托跨学科的途径，把一批专家的力量有效地结合起来，集中用于解决某个具体问题。把各知识领域的成果加以系统的综合，就能解决那些在单一学科和专门途径范围内无法解决的问题。
系统分析最初是作为支持战略决策的方法而创立的，它使人们能够在复杂情境中有依据地选择最优策略。今天，系统分析已从一种向管理者推荐最优行动方案的方法，发展为一种在研究中贯彻系统方法的应用性科学途径。
现代系统分析：
- 确立促成问题产生的因果关系；
- 在考虑约束条件、风险与环境不确定性的前提下，分析化解系统性问题的各种方案；
- 组织跨学科的科学研究与应用研究；
- 在复杂的管理情境中，就最优选择或合理的行动方案提出有依据的建议；
- 运用建模方法研究问题；
系统分析的研究内容：
- 运用系统方法诊断和解决复杂问题的方法；
- 组织以解决问题为目的的跨学科研究的方式；
- 全面研究和设计复杂系统的方法与模型。
系统分析的特点：
- 借助系统理论的概念描述研究对象；
- 研究目标确立的过程；
- 发展处理目标指标的工具；
- 用于解决具体问题；
- 考虑问题情境的特殊性；
- 在问题无法直接用形式化方法解决时加以运用；
- 重视对问题的描述和课题的提法；
- 把定量分析与定性分析的方法结合起来；
- 利用各领域专家的知识；
- 组织集体决策；
- 采用规定分析各阶段顺序与内容的方法；
- 采用把大问题分解为若干课题的系统方法；
与系统分析密切相关的学科与科学领域：
- 一般系统理论与系统方法；
- 运筹学与最优化；
- 决策理论；
- 控制理论与管理；
- 系统工程；
- 数学建模；
- 数据分析与统计；
- 计算机科学与人工智能；
- 科学哲学与科学方法论。