प्रणाली अभियांत्रिकी परियोजना प्रबंधन का एक हिस्सा है; इसकी जिम्मेदारियों में तकनीकी दिशा-निर्देशन, प्रणाली एकीकरण, और तकनीकी विभागों के समन्वय शामिल हैं।
किसी जटिल प्रणाली के निर्माण में दर्जनों या सैकड़ों लोगों के साथ-साथ उपठेकेदारों और अन्य संगठनों द्वारा किए जाने वाले अनेक अंतर्संबंधित कार्य शामिल होते हैं। इसमें न केवल विकास प्रक्रिया स्वयं शामिल है, बल्कि प्रणाली के संचालन को समर्थन देने के लिए सामान्यतः आवश्यक सभी चीज़ें भी शामिल हैं, जिनमें रखरखाव, दस्तावेज़ीकरण, प्रशिक्षण और बहुत कुछ शामिल है। परीक्षण तथा अन्य आवश्यक उपकरण, सुविधाएँ और वाहन विकसित, प्राप्त और उपलब्ध किए जाने चाहिए। परियोजना प्रबंधन या प्रणाली अभियांत्रिकी का कोई भी पक्ष अनदेखा नहीं किया जा सकता, जिसमें नियोजन, अनुसूचीकरण, लागत आकलन और कॉन्फ़िगरेशन प्रबंधन शामिल हैं।
प्रणाली अभियांत्रिकी के कार्यों में संकल्पनात्मक और विस्तृत डिज़ाइन के हर चरण में प्रणाली विकास का निर्देशन शामिल है। इसमें विशेष रूप से आवश्यकता विश्लेषण, ट्रेड-ऑफ अध्ययन (विकल्पों का विश्लेषण), तकनीकी समीक्षाएँ, परीक्षण और मूल्यांकन आवश्यकताएँ, प्रणाली-स्तरीय तकनीकी आवश्यकताएँ, कॉन्फ़िगरेशन प्रबंधन आदि शामिल हैं — यानी वह सब कुछ जो प्रणाली अभियांत्रिकी प्रबंधन योजना में शामिल होता है। एक अन्य महत्वपूर्ण गतिविधि परियोजना के आरंभिक चरण में विशेष अभियांत्रिकी को शामिल करना है — दूसरे शब्दों में, इसे सामान्यतः समवर्ती अभियांत्रिकी के रूप में जाना जाता है।
किसी जटिल प्रणाली को विकसित करते समय यह आवश्यक है कि प्रक्रिया में शामिल सभी प्रमुख प्रतिभागी न केवल अपने-अपने उत्तरदायित्व क्षेत्रों को जानें, बल्कि यह भी समझें कि एक-दूसरे के साथ किस प्रकार सहभागिता करनी है। जिस प्रकार प्रणाली इंटरफ़ेस को नियंत्रित करने के लिए समर्पित दस्तावेज़ीकरण आवश्यक होता है, उसी प्रकार विभिन्न उत्तरदायित्व क्षेत्रों और शासकीय निकायों के बीच के संबंधों को भी परिभाषित और प्रबंधित किया जाना चाहिए। यह सामान्यतः प्रणाली अभियांत्रिकी प्रबंधन योजना (SEMP) या किसी समतुल्य दस्तावेज़ को तैयार करके और वितरित करके प्राप्त किया जाता है।
SEMP का प्राथमिक कार्य यह सुनिश्चित करना है कि परियोजना के सभी अनेक प्रतिभागी — उपप्रणाली कार्य प्रमुख, घटक विकासकर्ता, परीक्षण इंजीनियर, प्रणाली विश्लेषक, विशेष अभियांत्रिकी कर्मी, उपठेकेदार आदि — एक-दूसरे के प्रति अपने दायित्वों को समझें। यह प्रणाली अभियांत्रिकी के उस कार्य के समरूप है जिसमें प्रणाली के घटकों के बीच अंतःक्रियाओं को परिभाषित किया जाता है, ताकि वे आपस में मिलकर सहज ढंग से कार्य करें। इसके अतिरिक्त, SEMP प्रणाली अभियांत्रिकी के अनेक कार्यों को करते समय अनुसरण की जाने वाली प्रक्रियाओं के लिए एक संदर्भ मार्गदर्शिका के रूप में भी कार्य करता है।
SEMP एक जीवंत दस्तावेज़ है जो आरंभ में केवल सामान्य सिद्धांतों को शामिल करता है, परंतु प्रणाली के विकसित होने के साथ इसे क्रमशः विस्तृत और अद्यतन किया जाता है। एक स्वीकृत SEMP होने से यह भी सुनिश्चित किया जा सकता है कि सभी नियोजित कार्य पूर्णतः संपन्न हुए हैं या नहीं।